En 2020, près de 8 600 exploitations de Bourgogne-Franche-Comté (BFC) ont déclaré au moins un signe officiel d’identification de la qualité et de l’origine, selon le ministère de l’Agriculture. Dans la région, 36 % des exploitations valorisent ainsi une partie de leur production sous AOP, IGP ou Label Rouge. Les appellations d’origine protégée (AOP) sont les plus fréquentes : plus de 6 800 exploitations déclarent au moins un produit sous AOP, soit 29 % des exploitations de la région, contre seulement 18 % au niveau national. Entre les deux derniers recensements de l’agriculture (2010 et 2020), le nombre total d’exploitations a diminué de 21 % en BFC. Mais cette dynamique change fortement selon la présence de SIQO ou non. Ainsi, près de 28 % des exploitations sans SIQO ont disparu, contre seulement 7 % pour celles qui avaient au moins un SIQO.
